Text

PlantOmics: The Omics of Plant Science

---

Istilah "omics" menggambarkan kelengkapan. Dalam dua dekade terakhir, istilah ini telah digabungkan dengan beberapa topik biologi untuk memberikan informasi yang lengkap tentang subjek tersebut. Dengan munculnya teknologi baru, arena "omics" meningkat dengan cepat. Namun, sebagian besar buku yang tersedia saat ini yang membahas tentang teknologi omics dan aplikasinya sebagian besar difokuskan pada sistem hewan. Untuk mengisi kesenjangan ini, kami telah memperkenalkan PlantOmics ini: Buku Omics of Plant Science untuk memberikan spektrum lengkap omics terkait tanaman kepada para mahasiswa dan peneliti yang bekerja di bidang bioteknologi molekuler tanaman mutakhir. Fokus yang sama telah diberikan pada kemajuan teknologi serta aplikasi spesifiknya. Oleh karena itu, buku ini memberikan penjelasan yang komprehensif mengenai perkembangan dan tren terkini dari pendekatan omics dalam ilmu tanaman. Beberapa topik juga menyoroti strategi omics integratif yang memungkinkan pengembangan tanaman unggul yang hemat biaya untuk berbagai tujuan. Buku ini terdiri dari 29 bab yang ditulis oleh 90 ahli dari 15 negara yang mewakili tiga perempat bagian dunia. Pada bab pendahuluan (Bab 1), Dr. Agrawal dan rekan-rekannya telah menggambarkan omics tanaman model di mana genomik, proteomik, transkriptomik, dan metabolomik tanaman model seperti Arabidopsis, padi, dan jagung dibahas secara rinci. Lebih lanjut, bab ini juga menjelaskan bagaimana pengetahuan yang diperoleh dari teknologi ini dapat digunakan untuk transgenomik, pemetaan cekaman biotik dan abiotik, dan seleksi dengan bantuan penanda untuk perbaikan tanaman. Pada Bab 2, kelompok Dr. Cozzolino telah memberikan gambaran yang bagus tentang teknik spektroskopi yang paling umum digunakan seperti NIR, MIR, dan Raman dalam analisis omik tanaman. Untuk membuat bab ini lebih bermanfaat, Dr. Cozzolino juga mendemonstrasikan instrumentasi dan perangkat lunak analitik untuk teknik-teknik spektroskopi ini. Topik hangat, sekuensing generasi berikutnya (NGS), teknologinya, berbagai platform, algoritme, dan perakitan de novo, anotasi, dan analisis genom tanaman diberikan oleh Dr. Tiwary di Bab 3. Bab 4, oleh Dr. Jha dan rekan-rekannya, memberikan penjelasan yang komprehensif tentang teknik-teknik yang terkait dengan genomik fungsional tanaman dan aplikasinya. Talukdar dan Sinjushin dalam Bab 5 telah menjelaskan berbagai teknik sitogenomik dan mutagenomik serta aplikasi hemat biaya dalam pemuliaan tanaman dan biologi. Bab ini juga menyoroti mutasi yang menyebabkan perubahan respons pertahanan antioksidan untuk menahan berbagai tekanan abiotik untuk mengungkapkan peristiwa seluler dan metabolisme intrinsik terhadap sensitivitas tanaman benih terhadap salinitas, kekeringan, toksisitas logam, dan tekanan lainnya, yang berpeluang merumuskan strategi pemuliaan yang efektif dalam kondisi agroklimat yang berbeda. Teknologi epigenomik dan potensi aplikasinya dalam perbaikan tanaman dirangkum dalam Bab 6 oleh Drs. Shafi q dan Khan. Secara khusus, bab ini menyoroti peran mekanisme renovasi kromatin dalam menanggapi rangsangan lingkungan dan perannya dalam perbaikan tanaman. Bab 7, oleh Dr. Boopathi, tentang Plant miRNomics memberikan penjelasan yang komprehensif untuk menjelaskan bagaimana miRNA mengatur ekspresi gen dan memainkan peran kunci dalam waktu perkembangan dan pola struktur dalam menanggapi rangsangan eksternal dan internal pada tanaman. Bab ini juga menjelaskan bagaimana miRNA dapat digunakan untuk meningkatkan respons tanaman terhadap stres. Bab 8, oleh Dr. Agrawal dan kelompoknya, menjelaskan kemajuan teknologi terkini dalam proteomik tanaman dan menyoroti pencapaian yang dibuat dalam memahami proteom tanaman dan aplikasinya. Di dalam Bab 9 , Dr. Sangwan dan rekan-rekannya menjelaskan berbagai platform teknologi dalam penelitian metabolomik tanaman dan bagaimana metabolomik digunakan dalam memantau dan menilai fungsi gen, respons stres, dan untuk mengkarakterisasi proses pasca-genomik dari perspektif yang luas bersama dengan tantangan yang dihadapi oleh domain tersebut. Kelompok Dr. Khurana dalam Bab 10 mengulas tentang kimia dan teknologi dalam glikomik tanaman. Bab ini juga memberikan ringkasan aplikasi glikomik dalam biofarmasi dan beberapa proses biologis seperti pensinyalan tanaman, respons stres, dan kekebalan. Pada bab berikutnya (Bab 11), Dr. Namasivayam menjelaskan tentang teknologi kimia dan analitik, pensinyalan lipid pada tanaman, lipidom pada mekanisme pertahanan tanaman, dan beberapa aspek lain dari lipidomik tanaman. Mekanisme komprehensif yang mengatur konstitutif dan secretome yang diinduksi dari beragam tanaman dan habitatnya bersama dengan pendekatan teknologi dibahas oleh Dr. Yadav dan kelompoknya di Bab 12. Dalam Bab 13, Dr. Rahman dan rekan-rekannya memberikan penjelasan rinci tentang pendekatan terintegrasi-omik dalam fenomenologi dan aplikasinya dalam tanaman dan pertanian. Bab 14, oleh Drs. Davies dan Stankovic, menjelaskan bagaimana metode baru berdasarkan mikroskop super cepat dan resolusi super dapat digunakan dalam menggambarkan protein, asam nukleat, sitoskeleton, dan molekul kecil yang sangat menarik bagi tanaman. Pada Bab 15, Dr. Karpiński dan rekan-rekannya mengedukasi kita tentang fisiomik tumbuhan. Bab ini memberikan wawasan tentang bagaimana peristiwa molekuler-fisiologis gabungan mendorong pertumbuhan, perkembangan, aklimatisasi, dan respons pertahanan tanaman. Vian dkk., dalam Bab 16, telah memperkenalkan istilah "Signalomics" dan telah menunjukkan bagaimana metode baru dapat digunakan untuk menganalisis sinyal sistemik termasuk sinyal listrik dan hidrolik pada tanaman. Dalam Bab 17, Dr. Talukdar dan rekan-rekannya menjelaskan penggunaan alat genomik fungsional mutakhir terbaru untuk memahami metabolisme tiol tanaman dari sumber (tanah) hingga tenggelam (biji-bijian) di berbagai bidang "thiolomics". Tiga bab berikutnya (Bab 18, 19, 20) didedikasikan untuk omik organel. Bab 18, oleh Dr. de Luna Valdez dkk., mengeksplorasi bagaimana kloroplas mengatur genom mereka dan mengatur transkriptom, proteom, dan metabolom mereka, mencoba untuk fokus pada pengetahuan klasik dan meninjau kumpulan data baru yang diperoleh melalui proyek penelitian berskala besar dan pendekatan sistem yang menjelaskan fungsionalitas kloroplas di bawah bab omoroplas. Dalam Bab 19, Dr. Khan merangkum perkembangan dari genomik plastid ke ekspresi gen dan secara singkat menjelaskan bagaimana transplastom memfasilitasi ekspresi vaksin, terapi, dan plantibodi, selain menyesuaikan sifat agronomi pada tanaman. Mustafa dan rekan-rekannya, menjelaskan secara rinci tentang regulasi gen mitokondria pada tingkat transkripsi, pasca transkripsi (penyambungan dan penyuntingan RNA), translasi, dan pasca translasi dalam perspektif omics. Bab 21 menjelaskan tentang "Mikromorfomik", sebuah istilah yang diciptakan oleh Dr. Tulika Talukdar untuk menjelaskan bagaimana tanaman memerangi tekanan lingkungan melalui manifestasi morfologi kolektif dalam arsitektur organ mereka. Bab 21 didedikasikan untuk mikrobiomik. Dalam bab ini, tim Dr. Sharma telah membahas teknologi untuk mengidentifikasi kelompok mikroorganisme baru yang terlibat dalam penyakit tanaman dari mikrobioma rizosfer dan peran mikrobioma dalam kesehatan tanaman dan bidang terkait. Martinez-Montero dan Harding dalam Bab 2 (Cryobionomics) bermaksud mengeksplorasi hubungan antara stabilitas dan faktor stres kriogenik/non-kriogenik dengan tujuan untuk membantu peningkatan protokol, optimasi, dan validasi untuk konservasi sumber daya genetik tanaman dengan beberapa contoh. Bab 24, oleh Dr. Kazi dan rekan-rekannya, berfokus pada pengembangan dan penggunaan "nanoteknologi" untuk memformulasikan bahan kimia penting dalam pertanian (pupuk) dengan sifat-sifat yang lebih berguna dan pengiriman langsung serta aplikasinya di berbagai sektor pertanian. Bab 25, oleh kelompok yang sama, secara sistemik menganalisis perkembangan terkini dalam farmakogenomik tanaman dan kontribusinya dalam bidang ilmu molekuler dan farmasi. Dr. Somvanshi dan rekan-rekannya dalam Bab 26 telah mencoba untuk menggambarkan beberapa pendekatan pembelajaran mesin dan aplikasinya dalam biologi tanaman dengan cara yang sangat sederhana. Demikian pula, dalam Bab 27, tim Dr. Sarika telah menekankan pada sejumlah aplikasi bioinformatika di bidang pertanian dalam pandangan genomik fungsional, teknik penambangan data, studi asosiasi seluruh genom, fasilitas komputasi berkinerja tinggi di bidang pertanian, dan berbagai alat / basis data bioinformatika yang penting bagi para pemulia, bioteknologi, dan ahli patologi. Bab 28 (Biologi sistem tanaman), oleh Drs. Bhardwaj dan Somvanshi, menjelaskan perkembangan terkini.

---

Availability

No copy data

Detail Information

Series Title

-

Call Number

572.86 BAR p

Publisher

Nonakuri, India : Springer., 2015

Collation

-

Language

English

ISBN/ISSN

978-81-322-2172-2

Classification

572.86

Content Type

text

Media Type

computer

Carrier Type

online resource

Edition

-

Subject(s)

Genomik, DNA

Specific Detail Info

-

Statement of Responsibility

Debmalya Barh, Muhammad Sarwar Khan, Eric Davies

Other Information

Cataloger

Erwin

Source

https://link.springer.com/10.1007/978-81-322-2172-2

Validator

-

Digital Object Identifier (DOI)

-

Journal Volume

-

Journal Issue

-

Subtitle

-

Parallel Title

-

Other version/related

File Attachment

Comments

---

You must be logged in to post a comment