Text
Practical Protein Bioinformatics
Metode bioinformatika menjadi bagian dari kotak peralatan standar laboratorium Ilmu Hayati. Diterapkan dengan bijak, pendekatan ini dapat sangat membatasi pekerjaan eksperimental dan melengkapi hasil yang diperoleh dengan metode "basah". Sementara banyak metode dan protokol bioinformatika belum cukup matang untuk digunakan oleh non-bioinformatika (dalam hal implementasi, atau kemudahan interpretasi hasil), banyak lainnya sudah pada tahap di mana mereka dapat digunakan oleh non ahli. Mereka dapat diakses melalui antarmuka web standar dari komputer mana pun terlepas dari perangkat keras atau sistem operasinya, mereka tidak memerlukan instalasi / pemeliharaan perangkat lunak tertentu, dan hasilnya mudah diinterpretasikan dan umumnya disajikan dalam cara interaktif grafis. Meskipun demikian, pengalaman kami menunjukkan bahwa banyak laboratorium basah tidak mengetahui banyak alat yang tersedia secara gratis. Buku ini membahas alat-alat yang bekerja dengan informasi yang berkaitan dengan protein. Hanya alat yang memenuhi jenis persyaratan yang disebutkan di atas yang disertakan. Misalnya, alat yang memerlukan penginstalan perangkat lunak, atau pemrosesan pra / pasca atau penguraian input atau hasilnya dibuang. Meskipun buku ini mencoba membahas secara menyeluruh semua aspek yang terkait dengan protein (dari sekuens genom hingga jaringan protein, mempelajari sekuens protein secara menyeluruh, dan struktur tiga dimensi), jumlah alat yang dikomentari di setiap kategori harus dibatasi, dan banyak alat dengan tujuan serupa tidak dikomentari. Seleksi ini, menurut definisi pribadi dan bias, didasarkan pada pengalaman kami sendiri bekerja di Fasilitas Analisis Protein di pusat penelitian Biologi Molekuler. Sudut pandang buku ini sangat praktis. Ini tidak dimaksudkan sebagai buku teks pengantar tentang Bioinformatika. Basis teoretis dari alat-alat tersebut hanya disebutkan secara tangensial selama pengetahuan tersebut diperlukan untuk menginterpretasikan hasil dengan lebih baik. Kami mencoba menjelaskan penggunaan alat dengan cara yang sama seperti protokol yang dijelaskan dalam buku Biologi Molekuler. Contoh-contoh praktis dengan protein nyata termasuk dalam bagian yang berbeda. Karena bidang bergerak sangat cepat dan banyak alat ditingkatkan, dilampaui, atau alamat web berubah atau hilang begitu saja, buku ini dikaitkan dengan situs web dinamis yang akan mencoba mencerminkan perubahan ini. Situs ini akan mempertahankan daftar alat yang diperbarui dan menyertakan informasi tentang peningkatan dan perubahan akhirnya. Situs ini dapat diakses di http://csbg.cnb.csic.es/PB/. Untuk setiap alat yang dibahas, tabel dengan informasi berikut disertakan: Tabel berisi nama dan deskripsi singkat alat tersebut, serta alamat web (URL) saat ini. URL "permanen" juga disertakan. Saat ini itu hanya pengalihan otomatis ke URL asli alat tersebut. Tetapi jika URL asli berubah atau hilang, URL permanen akan mencerminkan hal itu, memberikan informasi tentang perubahan tersebut, mengusulkan alat alternatif, dll. Terakhir, tabel berisi kode "quick response" (QR) yang dapat dipindai sehingga browser perangkat secara otomatis mengarahkan ke URL permanen. Referensi bibliografi alat juga disertakan sehingga pengguna yang tertarik dapat memperoleh lebih banyak informasi. Indeks dengan alat, serta "Bagaimana cara...?"indeks juga telah dimasukkan untuk memfasilitasi pelokalan prosedur / alat yang diminati. Terakhir, kami ingin mengucapkan terima kasih kepada para pengembang alat ini, yang menginvestasikan waktu dan sumber daya mereka untuk menciptakan dan memelihara ekosistem besar aplikasi web yang saling berhubungan yang memfasilitasi pekerjaan sehari-hari para ahli biologi molekuler. Memberikan resep praktis untuk menggunakan alat bioinformatika terkait protein, Mendemonstrasikan untuk laboratorium basah banyak alat yang tersedia secara gratis, Cocok di rak lab eksperimental manapun
No copy data
No other version available