Text
Proteogenomics
Konsep proteogenomik, memanfaatkan kemajuan dari bidang proteomik dan genomik, diperkenalkan sekitar waktu selesainya pengurutan genom manusia. Kemunculan proteogenomik terutama disebabkan oleh pesatnya perkembangan dua teknologi utama: pengurutan DNA dengan throughput tinggi dan proteomik berbasis spektrometri massa. Kemampuan untuk menentukan urutan protein dengan spektrometri massa telah menyediakan alat unik untuk identifikasi dan verifikasi gen baru, prediksi ekson, dan kerangka pembacaan terbuka. Akibatnya, proteogenomik telah digunakan untuk anotasi genom, termasuk validasi gen pengkode protein yang diketahui atau dianotasi; peningkatan anotasi gen yang menetapkan lokasi awal yang benar; pemetaan peptida sinyal, proteolisis, dan modifikasi pascatranslasional lainnya (sebuah elemen penting dari fungsi biologis yang tidak dikodekan secara langsung dalam genom); serta identifikasi varian penyambungan dan proteoform mutan yang sering dikaitkan dengan perkembangan penyakit. Mengingat kemajuan pesat dalam bidang ini, mungkin tepat untuk mendefinisikan proteogenomik sebagai bidang penelitian intensif yang menyelidiki korelasi antara data proteomik dan data genomik dan transkriptomik yang terkait, dengan tujuan untuk meningkatkan pengetahuan kita tentang kehidupan pada tingkat molekuler, yang merupakan tampilan lebih lengkap yang telah disarankan pada awalnya. Interaksi antara dua aliran data genomik dan proteomik tentunya memungkinkan pemahaman yang lebih baik tentang fungsi biologis dan mekanisme molekuler dalam kesehatan dan penyakit. Saat ini, pengurutan genom memberikan cakupan yang hampir lengkap, termasuk profil transkriptom, sementara proteomik yang ditargetkan dapat difokuskan pada wilayah tertentu dari proteom dan menentukan prediksi protein. Tujuan dari buku ini adalah untuk menampilkan pandangan luas mengenai proteogenomik, menggambarkan bidang penelitian di mana proteogenomik secara aktif memainkan peran penting dan juga menyoroti beberapa bidang penelitian yang muncul tanpa berpura-pura mencakup semua bidang penerapan. Bab-bab dalam buku ini menawarkan pembaca wawasan umum tentang analisis integratif berbagai jenis data omics dan menyajikan kemajuan dalam prinsip-prinsip spesifik, seperti pengurutan DNA generasi berikutnya, pengurutan mRNA, profil ribosom, serta spektrometri massa. - dan proteomik berbasis antibodi. Aplikasi ini dipilih untuk memberikan contoh potensi besar proteogenomik untuk berkontribusi pada penelitian penyakit manusia, khususnya kanker dan pengobatan yang dipersonalisasi. Yang penting, buku ini berupaya mengidentifikasi beberapa fitur umum yang mengintegrasikan berbagai bidang dan bidang di mana upaya intensif harus dilakukan untuk mendorong penelitian lebih efisien dalam waktu dekat. Salah satunya adalah bioinformatika, yang telah menunjukkan kekuatan dan perkembangan luar biasa selama beberapa tahun terakhir dan diharapkan dapat memberikan pendekatan yang kuat untuk meningkatkan kemampuan kita dalam bekerja dan menggabungkan kumpulan data besar yang dihasilkan oleh genomik, transkriptomik, dan proteomik. Pada akhirnya, saya ingin mengucapkan terima kasih kepada semua penulis buku ini atas kontribusi luar biasa mereka, berbagi pandangan ahli mereka di bidang ini, dan menyajikan penelitian asli mereka. Antusiasme mereka dan pengiriman naskah yang tepat waktu sangat membantu saya dalam merealisasikan proyek ini. Harapan tulus saya adalah agar para pembaca dapat menikmati buku ini seperti halnya saya menikmati persiapannya.
No copy data
No other version available