Text
Data and Text Processing for Health and Life Sciences
Buku akses terbuka ini merupakan pengantar langkah demi langkah tentang bagaimana skrip shell dapat membantu menyelesaikan banyak tugas pemrosesan data yang dihadapi oleh spesialis Kesehatan dan Kehidupan setiap hari dengan ketergantungan perangkat lunak yang minimal. Contoh-contoh yang disajikan dalam buku ini menunjukkan bagaimana alat baris perintah sederhana dapat digunakan dan dikombinasikan untuk mengambil data dan teks dari sumber daya web, untuk menyaring dan menambang literatur, dan untuk mengeksplorasi semantik yang dikodekan dalam ontologi biomedis. Untuk menyimpan data, buku ini bergantung pada format file teks standar terbuka, seperti TSV, CSV, XML, dan OWL, yang dapat dibuka oleh editor teks atau aplikasi spreadsheet apa pun. Dua bab pertama, Pendahuluan dan Sumber Daya, memberikan pengantar singkat tentang skrip shell dan menjelaskan sumber daya data populer dalam Ilmu Kesehatan dan Kehidupan. Bab ketiga, Pengambilan Data, dimulai dengan memperkenalkan tugas pemrosesan data umum yang melibatkan beberapa sumber daya data. Kemudian, bab ini menjelaskan cara mengotomatiskan setiap langkah tugas tersebut dengan memperkenalkan alat baris perintah yang diperlukan satu per satu. Bab keempat, Pemrosesan Teks, menunjukkan cara menyaring dan menganalisis teks dengan menggunakan teknik pencocokan string sederhana dan ekspresi reguler. Bab terakhir, Pemrosesan Semantik, menunjukkan bagaimana kueri XPath dan skrip shell mampu memproses data kompleks, seperti grafik yang digunakan untuk menentukan ontologi. Selain hampir tidak dapat diubah selama lebih dari empat dekade dan tersedia di sebagian besar komputer pribadi kita, skrip shell relatif mudah dipelajari oleh spesialis Kesehatan dan Kehidupan sebagai rangkaian perintah independen. Memahaminya seperti melakukan protokol laboratorium baru dengan menguji dan memahami langkah-langkah prosedural dan variabelnya, dan menggabungkan hasil antara mereka. Dengan demikian, buku ini sangat relevan bagi spesialis Kesehatan dan Kehidupan atau mahasiswa yang ingin mempelajari cara memproses data dan teks dengan mudah, dan yang pada gilirannya dapat memfasilitasi dan menginspirasi mereka untuk memperoleh keterampilan bioinformatika yang lebih mendalam di masa mendatang.
No copy data
No other version available